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研究肺癌患者在东亚人和高加索人群的
分子基因突变谱和肿瘤突变负荷及预后差异
TLCR
论文成功发表于
TranslationalLungCancerResearch
中科院1区，影响因子4.8PartOne
研究背景
为探究不同人种间肺腺癌患者在分子基因突变谱、肿瘤突变负荷和预后的差异，我们纳医院的例肺腺癌患者，并与TCGA公开数据库中的例肺腺癌患者（86.6%为高加索人）进行对比研究。
通过49例中国和79例高加索肺腺癌患者的全外显子数据，我们着重对比了基因突变频率、信号通路变异和肿瘤突变负荷TMB三个方面的差异。
PartTwo
研究结果
每个基因突变频率按照11条信号通路进行归类统计，包含在RTK-RAS、NRF2、TGF-β、PI3K、WNT、MYC、Hippo、p53、cellcycle、Notch和DDR信号通路。
研究结果发现：
①基因突变频率在中国和高加索的肺腺癌患者人群间有显著性差异，如NOTCH2和TGFβR2（图1）。
②中国肺腺癌患者中TGF-β和RTK-RAS信号通路的基因突变，显著性高于其在高加索肺腺癌患者人群（图2）。
图1：11条信号通路的基因突变频率在TCGA和东亚人群肺腺癌患者间的差异
图2：TGF-β和RTK-RAS信号通路的基因突变在东亚人群中显著性高于TCGA数据集人群
研究发现，中国肺癌患者的肿瘤突变负荷TMB平均值为4.61mutations/MB，而高加索肺腺癌患者TMB则为3.26mutations/MB，且两组人群间TMB平均值并无显著性差异。
在基因突变与TMB的相关性研究中（图3），有EGFR基因突变与TMB-L显著相关，有17个基因突变与TMB-H显著相关，分别是FAT2/3/4、DCHS2、MGA、DNER、CNTN6、TP53、POLE、PIK3R1、ROS1、ACVR2A、SFRP4。
然而在突变信号通路与TMB的相关性分析中中国肺腺癌患者与高加索肺腺癌患者则表现出了明显的差异（图4），中国患者与TMB-H显著相关的仅有Notch信号通路，而高加索患者则有Notch、WNT、Hippo、PI3K、Myc共五条。
图3：与TMB显著相关性的基因突变
图4：突变信号通路与TMB在TCGA和东亚人群的相关性
在EGFR基因对肺腺癌早期患者预后影响的分析中，东亚人群中携带EGFR突变肺腺癌患者比EGFR野生型患者有着更好的预后，但在高加索人群中这一情况正好相反，即EGFR野生型早期患者比EGFR突变型有更好的预后。但这一现象在肺腺癌晚期患者中，并无明显差别。
图5：EGFR突变对早期肺腺癌患者总生存期的影响
PartThree
结语
本研究通过肺腺癌患者全外显子数据首次系统性地分析了遗传变异与肿瘤突变负荷TMB之间的关系，并对比了其在东亚和高加索之间的患者人群差异。
在两个患者人群中，突变基因主要显著性富集在TFGβ和RTK-RAS信号通路，而在东亚肺腺癌患者中有6个突变基因和1条突变信号通路与TMB升高显著相关，在高加索肺腺癌患者中则有18个基因和5条信号通路与之显著相关。
最后，我们发现：TMB与肺腺癌患者的预后无直接相关性，而EGFR突变在东亚人群中提示肺腺癌患者有更好的预后，但在高加索人群中却与之相反。
END
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